Link muss das Böse bei jeder Gelegenheit in seinem gefährlichen Streben besiegen, um Prinzessin Zelda zu helfen!

Es war einmal, als Zauberer versuchten, das Heilige Reich von Hyrule zu erobern. Die Geister des Lichts versiegelten die Macht der Zauberer im Schattenkristall und verbannten sie ins Zwielichtreich jenseits des Spiegels des Zwielichts. Nun versucht eine böse Bedrohung, Midna, die Prinzessin des Zwielichtreichs, und die Fragmente des Schattenkristalls zu finden, um die Macht zu erlangen, sowohl über das Zwielichtreich als auch über die Welt des Lichts zu herrschen.

Midna erzählt Link von der Zeit, bevor sie in die Welt des Lichts kam, und wie der böse Zauberer Zant sie in ihre jetzige Form verwandelte. Verbittert und wütend benutzte Midna nur andere Menschen, um sich zu rächen. Link braucht Midnas Hilfe jetzt mehr denn je, und seine Vergebung könnte ihr die Kraft geben, den Kampf fortzusetzen. Vor ihnen liegen im Zwielichtreich selbst größere Gefahren als je zuvor, sowie Midnas Erzfeind, der hinterlistige Zauberer Zant.