Der Oberschüler Hajime Hinata muss der Beste in etwas sein - schließlich wurde er an der Hope's Peak Academy angenommen, die nur die besten Jugendlichen des Landes aufnimmt (egal, ob sie Elite-Gangster, Turner oder Hamsterzüchter sind!).

Aber er weiß nicht, was sein besonderes Talent ist... nur dass er und seine Klassenkameraden einen überraschenden Sommerurlaub auf Jabberwock Island bekommen haben. Es mag ein tropisches Paradies sein, aber ihr hinterhältiger Teddybären-Schulleiter Monokuma erwartet immer noch, dass sie alle ihre Aufgaben erledigen, wenn sie jemals nach Hause wollen - nämlich einen Mitstudenten ermorden und damit davonkommen, während die Überlebenden sich in einem Klassenzimmerprozess gegenseitig befragen!

Danganronpa 2: Goodbye Despair ist eine alternative Version der Ereignisse, die in dem Manga Danganronpa 2: Ultimate Luck and Hope and Despair erzählt werden. Diese Serie erzählte die Geschichte aus der Sicht des ultimativen Glücksschülers Nagito Komaeda; jetzt gibt dir Goodbye Despair die Perspektive seines Erzrivalen im verzweifelten Klassenzimmer-Mordspiel, Hajime Hinata!