Studentul de liceu Hajime Hinata trebuie să fie cel mai bun la ceva - în fond, a fost acceptat la Academia Hope's Peak, care primește doar adolescenți de elită din țară (indiferent dacă sunt de elită în a fi gangsteri, gimnaști sau crescători de hamsteri!).

Dar el nu știe care este talentul său special... doar că el și colegii săi au primit o vacanță surpriză de vară pe Insula Jabberwock. Poate fi un paradis tropical, dar ursul de pluș sinistru, directorul lor Monokuma, se așteaptă ca ei toți să-și îndeplinească sarcinile dacă vor să se întoarcă acasă - în special, să ucidă un coleg de clasă și să scape nepedepsiți, în timp ce supraviețuitorii se interoghează reciproc într-un proces în sala de clasă!

Danganronpa 2: Goodbye Despair este o versiune alternativă a evenimentelor povestite în manga Danganronpa 2: Ultimate Luck and Hope and Despair. Acea serie a povestit prin ochii lui Nagito Komaeda, studentul norocos suprem; acum, Goodbye Despair îți oferă perspectiva rivalului său în jocul disperat de asasinat în sala de clasă, Hajime Hinata!