Mit dem Mörder Mitsuo Kubo, der gefasst wurde, und dem Fall, der scheinbar abgeschlossen ist, kehrt das Leben in Inaba zu seinen normalen Rythmen zurück, genau zu dem Zeitpunkt, an dem Soji und seine Freunde ihre Sommerferien genießen können. Doch die Anpassung erweist sich als besonders schwierig für Naoki Konishi, für den die Zeit stillgestanden hat, seit seine Schwester Saki das zweite Opfer des Verbrechens wurde. Können Soji und Yosuke den Frieden finden, den sie suchen, und ist die Untersuchung von Soji und seinen Freunden tatsächlich beendet? Basierend auf dem beliebten Videospiel Persona 4!