Ο κόσμος αλλάζει και ο Rintaro Okabe βρίσκει τον εαυτό του να ξυπνά στο μέλλον. Το έτος; 2036. Ο κόσμος φαίνεται ακριβώς όπως είχε προειδοποιηθεί γι' αυτόν: μια κόλαση γεμάτη θάνατο και καταστροφή. Μετά από αυτήν την απογοητευτική μοίρα, ο Rintaro στέκεται ψηλά και ενδυναμώνει την καρδιά του, αποφασισμένος να θέσει τέλος σε αυτό το μέλλον μια για πάντα. Οι ήρωες του Steins;Gate επιστρέφουν για μια νέα ιστορία που αλλάζει τον χρόνο, σε έναν εναλλακτικό κόσμο όπου τα μέλη του Future Gadget Lab απέτυχαν στην αρχική τους αποστολή. Μπορεί μια τελευταία ευκαιρία να οδηγήσει σε ένα ευτυχισμένο τέλος;