Das Räuchern reifer Jalapeno-Früchte ist eine traditionelle Methode zur Trocknung und Konservierung, die seit Jahrhunderten verwendet wird. Diese spezielle Technik wurde von den Azteken entwickelt. Für das Räuchern wird Mesquite-Holz verwendet, das den getrockneten Früchten einen intensiven, rauchigen Geschmack verleiht. Das geräucherte Jalapeno ist bekannt als Chipotle.