Der Takumi Sumino ist ein ganz gewöhnlicher Jugendlicher, der im Tokyo Residential Complex lebt, einem Ort, an dem jeder Tag dem vorherigen ähnelt und nichts Schlechtes passiert. Alles ändert sich, als seltsame Monster die Stadt angreifen und Chaos verursachen. Ein mysteriöser Charakter, der sich Sirei nennt, taucht auf und bietet Takumi die Macht, diejenigen, die er liebt, zu beschützen... Das Einzige, was er tun muss, ist sich in die Brust zu schießen! Das Nächste, was er weiß, ist, dass Takumi an der Academy of Last Defense ist, einer Schule in der Mitte des Nirgendwo, umgeben von einer Mauer aus übernatürlichen Flammen. Er und 14 andere Schüler wurden in den Special Defense Service aufgenommen, eine Gruppe, die die Verantwortung trägt, die Schule für die nächsten 100 Tage sicher zu halten. Wie viel sind sie bereit zu opfern, um ihr normales Leben wiederherzustellen und die Welt vor den unheimlichen Invasoren der Schule zu retten? Das Vorhang hebt sich für 100 Tage Krieg und Verzweiflung...