Η μπαταρία του iPhone 16 Plus είναι τύπου ιόντων λιθίου (Li-ion) με ονομαστική χωρητικότητα 4.674 mAh. Η τάση λειτουργίας της είναι περίπου 3.83 V, ενώ η συνολική ενέργεια που μπορεί να αποθηκεύσει είναι περίπου 17.9 Wh. Η Apple αναφέρει ότι η συνδυασμένη λειτουργία του επεξεργαστή A18 και η διαχείριση ενέργειας του iOS εξασφαλίζουν εξαιρετική αυτονομία, με διάρκεια έως 27 ώρες για αναπαραγωγή βίντεο και έως 100 ώρες για αναπαραγωγή ήχου.
Υποστηρίζει γρήγορη ενσύρματη φόρτιση μέσω USB-C 20W και ασύρματη φόρτιση MagSafe έως 25W.