Die Flensburger Brauerei ist eine Brauerei in Flensburg, Schleswig-Holstein, Deutschland. Sie wurde am 6. September 1888 von fünf Flensburger Bürgern gegründet und wird heute hauptsächlich von den Gründerfamilien Petersen und Dethleffsen geführt.

Bevor moderne Kühlmethoden erfunden wurden, nutzte die Brauerei im Winter Eisstücke aus zugefrorenen Seen, um die unterirdischen Lagerräume im Sommer kühl zu halten. Die Brauerei betreibt noch immer einen eigenen Brunnen, der von einer unterirdischen Quelle mit sehr altem Schmelzwasser aus der Eiszeit gespeist wird, das aus Skandinavien stammt.