Die Flensburger Brauerei ist eine Brauerei in Flensburg, Schleswig-Holstein, Deutschland. Sie wurde 1888 von fünf Bürgern Flensburgs gegründet. Heute bleibt sie hauptsächlich im Besitz der Gründerfamilien Petersen und Dethleffsen.

Vor den modernen Kühlmethoden nutzte die Brauerei im Winter Eisblöcke aus zugefrorenen Seen, um die unterirdischen Anlagen im Sommer kühl zu halten. Darüber hinaus betreibt sie ihren eigenen Wasserbrunnen, der von einer unterirdischen Ader sehr alten Schmelzwassers aus der skandinavischen Eiszeit gespeist wird.