In naher Zukunft erscheint ein gigantisches und mysteriöses Objekt unbekannter Herkunft in der Umlaufbahn der Erde. Aufgrund seiner Form wird es von der Welt Metaedro genannt. Eine vierköpfige Crew namens S.C.A.R. (Sentient Contact Assessment and Response) reist mit dem Raumschiff Hermes, um das geheimnisvolle Alien-Objekt zu analysieren.

Als sie sich Metaedro nähern und es elektronisch scannen, beginnt das Objekt Hermes zu sich zu ziehen. Die Crew verliert die Kontrolle über das Schiff und alles wird weiß. Die Heldin des Spiels, Kate, erwacht auf einem fremden Planeten - sie ist allein und der Rest der Crew ist nicht zu sehen. Als sie Visionen einer geisterhaften Gestalt sieht, entdeckt sie, dass seit Beginn ihrer Mission Wochen oder sogar Monate vergangen sind. Kate erfährt auch, dass ihr Team es geschafft hat, auf dem Planeten zu überleben. Während sie nach ihnen sucht, entdeckt sie, dass der Anführer der Mission (Robinson) sich in eine groteske Kreatur verwandelt hat, aber Tamara und Mike (die anderen Mitglieder) noch am Leben sind, obwohl Mike anscheinend anfängt, sich zu verändern und Tamara verschwunden ist, während sie nach einem Weg sucht, ihm zu helfen. So beginnt eine Mission, sie zu finden und zu retten.