Ein gewöhnlicher Teenager namens Shinichi Izumi lebt mit seinen Eltern in einer ruhigen Nachbarschaft, bis Außerirdische Parasiten einfallen. Es sind Wesen, die wie Würmer aussehen und in menschliche Wirte über die Ohren oder die Nase eindringen und deren Gehirn kontrollieren. Ein Parasit versucht, in Shinichis Ohr einzudringen und sein Gehirn zu kontrollieren, während er schläft, wird aber durch seine Kopfhörer gestoppt und dringt versehentlich in eine seiner Hände ein. Mit getrennten Intelligenzen kämpfen er und sein Parasit Migi gegen die Invasion der Stadt.